Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCCQ00597 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms