Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms