Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK6Q00534 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK6Q00534 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms