Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNB1P98172 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms