Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms