Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS9P82933 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS9P82933 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS9P82933 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS9P82933 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS9P82933 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPS9P82933 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPS9P82933 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms