Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPD3P62318 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms