Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTBP60709 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms