Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00315P59091 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00315P59091 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00315P59091 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00315P59091 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00315P59091 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms