Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX16P57768 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX16P57768 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX16P57768 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX16P57768 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX16P57768 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX16P57768 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX16P57768 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX16P57768 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX16P57768 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX16P57768 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX16P57768 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX16P57768 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms