Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMDP57764 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms