Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN12P56749 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN12P56749 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms