Protein–RNA interactions for Protein: P54687

BCAT1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAT1P54687 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAT1P54687 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAT1P54687 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms