Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms