Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF135P52742 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms