Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCAMP50895 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCAMP50895 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAMP50895 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAMP50895 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAMP50895 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAMP50895 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms