Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK7P50613 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK7P50613 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK7P50613 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK7P50613 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK7P50613 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms