Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP153P49790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP153P49790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP153P49790 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP153P49790 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP153P49790 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP153P49790 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP153P49790 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP153P49790 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP153P49790 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP153P49790 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP153P49790 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP153P49790 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP153P49790 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP153P49790 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP153P49790 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP153P49790 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms