Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNTAP49354 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNTAP49354 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNTAP49354 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNTAP49354 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNTAP49354 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNTAP49354 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms