Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A3P47895 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms