Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms