Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms