Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms