Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms