Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP1P32455 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP1P32455 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP1P32455 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP1P32455 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms