Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3AP31941 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms