Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND2P30279 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND2P30279 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND2P30279 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND2P30279 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND2P30279 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND2P30279 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND2P30279 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND2P30279 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND2P30279 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND2P30279 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND2P30279 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND2P30279 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND2P30279 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms