Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms