Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms