Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms