Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD34P28906 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD34P28906 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD34P28906 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD34P28906 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD34P28906 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD34P28906 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms