Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB6P28072 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB6P28072 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms