Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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