Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYF6P23409 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYF6P23409 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYF6P23409 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYF6P23409 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYF6P23409 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYF6P23409 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYF6P23409 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms