Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD247P20963 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD247P20963 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD247P20963 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD247P20963 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD247P20963 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms