Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EFNA1P20827 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms