Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A1P19634 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms