Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCP1P17987 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCP1P17987 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms