Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPEP16870 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPEP16870 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPEP16870 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPEP16870 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CPEP16870 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CPEP16870 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CPEP16870 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CPEP16870 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CPEP16870 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CPEP16870 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPEP16870 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CPEP16870 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPEP16870 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPEP16870 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPEP16870 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPEP16870 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPEP16870 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPEP16870 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPEP16870 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms