Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB3P16520 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms