Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMP3P12645 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BMP3P12645 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP3P12645 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP3P12645 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP3P12645 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP3P12645 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMP3P12645 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP3P12645 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMP3P12645 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BMP3P12645 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms