Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBP3P10745 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RBP3P10745 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBP3P10745 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBP3P10745 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBP3P10745 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP3P10745 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP3P10745 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP3P10745 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP3P10745 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP3P10745 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms