Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALM1P0DP23 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALM1P0DP23 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms