Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC192P0DO97 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms