Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L5P0DN76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms