Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms