Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOD2P04179 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOD2P04179 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOD2P04179 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOD2P04179 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOD2P04179 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms