Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV12-3P01733 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms