Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM8O95777 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM8O95777 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM8O95777 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM8O95777 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM8O95777 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM8O95777 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM8O95777 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM8O95777 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM8O95777 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSM8O95777 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM8O95777 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms