Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms